O Projeto de Educação para a Saúde visa promover a literacia em saúde, promover atitudes e valores que suportem comportamentos saudáveis, valorizar comportamentos que conduzam a estilos de vida saudáveis, criar condições ambientais para uma Escola Promotora de Saúde, universalizar o acesso à educação para a saúde em meio escolar, qualificar a oferta da educação para a saúde em meio escolar e consolidar o apoio aos projetos em meio escolar.
As áreas prioritárias a desenvolver na Educação para a Saúde são a Saúde Mental e Prevenção da Violência, Educação Alimentar e Atividade Física, Comportamentos aditivos e dependências, Afetos e Educação para a Sexualidade e Saúde oral.